Р.М.Юсупов является членом-корреспондентом Российской академии наук по Отделению нанотехнологий и информационных технологий, избран почетным академиком Академии наук республики Татарстан, является почетным профессором Академии космических войск им.А.Ф.Можайского. Р.М.Юсупов – выдающийся ученый в области информатики и теории управления, основатель и руководитель научных школ по теории чувствительности информационно-управляющих систем и научно-методологическим основам информатизации общества. За достижения в области педагогики и просветительства Р.М. Юсупов награжден Международной премией имени Николая Рериха. Р.М.Юсупов является автором более 350 научных трудов, в том числе 20 монографий и 17 изобретений. Им подготовлено 13 докторов наук и 45 кандидатов наук, среди его учеников руководители научных организаций и фирм.